Primena Real-time RT-PCR metode u detekciji SARS-CoV-2
Конференцијски прилог (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
Globalna pandemija teškim akutnim respiratornim sindromom korona virusom 2 (SARSCoV-2) još uvek traje. Od samog početka pandemije, brza i tačna detekcija SARS-CoV-2 je bila
od suštinskog značaja. Lančana reakcija polimeraze (eng. Polymerase chain reaction, PCR)
sa reverznom transkripcijom (RT) u realnom vremenu (eng. Real-time), rtRT-PCR ostaje zlatni standard za detekciju genoma SARS-CoV-2 u biološkom materijalu. Preporučeni biološki
materijal za rutinsku kliničku praksu je nazofaringealni ili orofaringealni bris. Vreme uzorkovanja za analizu je veoma značajno i treba da se izvrši što je pre moguće od pojave simptoma. rtRT-PCR se može izvesti na uzorcima bez ili sa izolovanom ribonukleinskom kiselinom
(RNK). Ekstrakcija ukupne humane i virusne RNK može se obaviti različitim komercijalnim
kompletima. S druge strane, biološki materijali iz kojih nije izolovana RNK se koriste direktno
u rtRT-PCR nakon inaktivacije virusa i oslobađanja RNK pomoću lizirajućeg pufera. rtRT-PCR
metodo...logija obično uključuje dva koraka. Prvi korak je RT, a drugi korak je PCR sa detekcijom PCR produkata u realnom vremenu. U većini dijagnostičkih testova, ove dve reakcije se
odvijaju sukcesivno u istoj reakcionoj smeši. Dijagnostički reagensi sadrže oligonukleotide
kojima se amplifikuje jedna humana sekvenca (koja predstavlja internu pozitivnu kontrolu) i
oligonukleotide kojima se amplifikuju od jedne do tri virusne sekvence. Fluorescentni signal
za virusne gene mora da se pojavi pre 40. ciklusa i kriva amplifikacije treba da ima tipičan
S-oblik. Pouzdanost rezultata rtRT-PCR zavisi od mnogih faktora koji uključuju prikupljanje i
obradu uzoraka, metode izolacije RNK, tipove enzima za RT i PCR, vrste proba, izbor instrumenata, metoda analize rezultata i obučenost laboratorijskog osoblja
Извор:
Simpozijum "Covid-19 infekcija-dijagnostički i prognostički biohemijski parametri", Program i zbornik sažetaka, 18.03.2022, Beograd, 2022, 9-9Издавач:
- Udruženje farmaceuta Beograd
Финансирање / пројекти:
- Pod pokroviteljstvom Ministarstva zdravlja Republike Srbije " Hitan odgovor Republike Srbije na COVID-19”
Напомена:
- Predavanje je održano na Simpozijumu COVID-19 infekcija – dijagnostički i prognostički biohemijski parametri u Beogradu pod pokroviteljstvom Ministarstva zdravlja Republike Srbije, Projekat „Hitan odgovor Republike Srbije na COVID-19”.
Институција/група
PharmacyTY - CONF AU - Ninić, Ana PY - 2022 UR - https://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/5584 AB - Globalna pandemija teškim akutnim respiratornim sindromom korona virusom 2 (SARSCoV-2) još uvek traje. Od samog početka pandemije, brza i tačna detekcija SARS-CoV-2 je bila od suštinskog značaja. Lančana reakcija polimeraze (eng. Polymerase chain reaction, PCR) sa reverznom transkripcijom (RT) u realnom vremenu (eng. Real-time), rtRT-PCR ostaje zlatni standard za detekciju genoma SARS-CoV-2 u biološkom materijalu. Preporučeni biološki materijal za rutinsku kliničku praksu je nazofaringealni ili orofaringealni bris. Vreme uzorkovanja za analizu je veoma značajno i treba da se izvrši što je pre moguće od pojave simptoma. rtRT-PCR se može izvesti na uzorcima bez ili sa izolovanom ribonukleinskom kiselinom (RNK). Ekstrakcija ukupne humane i virusne RNK može se obaviti različitim komercijalnim kompletima. S druge strane, biološki materijali iz kojih nije izolovana RNK se koriste direktno u rtRT-PCR nakon inaktivacije virusa i oslobađanja RNK pomoću lizirajućeg pufera. rtRT-PCR metodologija obično uključuje dva koraka. Prvi korak je RT, a drugi korak je PCR sa detekcijom PCR produkata u realnom vremenu. U većini dijagnostičkih testova, ove dve reakcije se odvijaju sukcesivno u istoj reakcionoj smeši. Dijagnostički reagensi sadrže oligonukleotide kojima se amplifikuje jedna humana sekvenca (koja predstavlja internu pozitivnu kontrolu) i oligonukleotide kojima se amplifikuju od jedne do tri virusne sekvence. Fluorescentni signal za virusne gene mora da se pojavi pre 40. ciklusa i kriva amplifikacije treba da ima tipičan S-oblik. Pouzdanost rezultata rtRT-PCR zavisi od mnogih faktora koji uključuju prikupljanje i obradu uzoraka, metode izolacije RNK, tipove enzima za RT i PCR, vrste proba, izbor instrumenata, metoda analize rezultata i obučenost laboratorijskog osoblja PB - Udruženje farmaceuta Beograd C3 - Simpozijum "Covid-19 infekcija-dijagnostički i prognostički biohemijski parametri", Program i zbornik sažetaka, 18.03.2022, Beograd T1 - Primena Real-time RT-PCR metode u detekciji SARS-CoV-2 SP - 9 EP - 9 UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_farfar_5584 ER -
@conference{ author = "Ninić, Ana", year = "2022", abstract = "Globalna pandemija teškim akutnim respiratornim sindromom korona virusom 2 (SARSCoV-2) još uvek traje. Od samog početka pandemije, brza i tačna detekcija SARS-CoV-2 je bila od suštinskog značaja. Lančana reakcija polimeraze (eng. Polymerase chain reaction, PCR) sa reverznom transkripcijom (RT) u realnom vremenu (eng. Real-time), rtRT-PCR ostaje zlatni standard za detekciju genoma SARS-CoV-2 u biološkom materijalu. Preporučeni biološki materijal za rutinsku kliničku praksu je nazofaringealni ili orofaringealni bris. Vreme uzorkovanja za analizu je veoma značajno i treba da se izvrši što je pre moguće od pojave simptoma. rtRT-PCR se može izvesti na uzorcima bez ili sa izolovanom ribonukleinskom kiselinom (RNK). Ekstrakcija ukupne humane i virusne RNK može se obaviti različitim komercijalnim kompletima. S druge strane, biološki materijali iz kojih nije izolovana RNK se koriste direktno u rtRT-PCR nakon inaktivacije virusa i oslobađanja RNK pomoću lizirajućeg pufera. rtRT-PCR metodologija obično uključuje dva koraka. Prvi korak je RT, a drugi korak je PCR sa detekcijom PCR produkata u realnom vremenu. U većini dijagnostičkih testova, ove dve reakcije se odvijaju sukcesivno u istoj reakcionoj smeši. Dijagnostički reagensi sadrže oligonukleotide kojima se amplifikuje jedna humana sekvenca (koja predstavlja internu pozitivnu kontrolu) i oligonukleotide kojima se amplifikuju od jedne do tri virusne sekvence. Fluorescentni signal za virusne gene mora da se pojavi pre 40. ciklusa i kriva amplifikacije treba da ima tipičan S-oblik. Pouzdanost rezultata rtRT-PCR zavisi od mnogih faktora koji uključuju prikupljanje i obradu uzoraka, metode izolacije RNK, tipove enzima za RT i PCR, vrste proba, izbor instrumenata, metoda analize rezultata i obučenost laboratorijskog osoblja", publisher = "Udruženje farmaceuta Beograd", journal = "Simpozijum "Covid-19 infekcija-dijagnostički i prognostički biohemijski parametri", Program i zbornik sažetaka, 18.03.2022, Beograd", title = "Primena Real-time RT-PCR metode u detekciji SARS-CoV-2", pages = "9-9", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_farfar_5584" }
Ninić, A.. (2022). Primena Real-time RT-PCR metode u detekciji SARS-CoV-2. in Simpozijum "Covid-19 infekcija-dijagnostički i prognostički biohemijski parametri", Program i zbornik sažetaka, 18.03.2022, Beograd Udruženje farmaceuta Beograd., 9-9. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_farfar_5584
Ninić A. Primena Real-time RT-PCR metode u detekciji SARS-CoV-2. in Simpozijum "Covid-19 infekcija-dijagnostički i prognostički biohemijski parametri", Program i zbornik sažetaka, 18.03.2022, Beograd. 2022;:9-9. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_farfar_5584 .
Ninić, Ana, "Primena Real-time RT-PCR metode u detekciji SARS-CoV-2" in Simpozijum "Covid-19 infekcija-dijagnostički i prognostički biohemijski parametri", Program i zbornik sažetaka, 18.03.2022, Beograd (2022):9-9, https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_farfar_5584 .