Chemometric window to antimicrobial activity of biomolecules isolated from endophytic fungi
Hemometrijski prozor ka antibakterijskoj aktivnosti biomolekula izolovanih iz endofitnih gljiva
Članak u časopisu (Objavljena verzija)
Metapodaci
Prikaz svih podataka o dokumentuApstrakt
Drug resistance, especially bacterial antibiotic resistance, is recognized as a global phenomenon. Potential of endophytic fungi as producers of secondary metabolites with wide spectra of different bioactivities in the field of drug discovery has recently been introduced. The production of these compounds is under the great impact of the variety of factors related to the choice of plant host, climate conditions, nutrition, presence of other microorganisms in the same surrounding, etc. Due to a large number of different indices of endophytic fungi antibacterial activity, critical evaluation with the assistance of data mining analytical methods was performed. The activity towards several pathogen bacteria of endophytes species growing on different plant hosts, deciduous trees as well as herbaceous plants spread worldwide in different climatic zones together with the taxonomy of endophytes was taken into consideration. The principal component analysis was used to explore formed big data s...et and through finding patterns in data, to point out to a limited number of proper candidates for future pharmaceutical research. The antimicrobial character of Phomopsis species was highlighted and future perspectives in their therapeutic use were projected.
Rezistencija na lekove, posebno rezistencija bakterija na delovanje antibiotika, smatra se globalnim problemom. Na polju razvoja novih lekova nedavno su se pojavile endofitne gljive zahvaljujući sposobnosti da proizvedu sekundarne metabolite sa širokim spektrom različitih bioloških aktivnosti. Biosinteza ovih jedinjenja je pod velikim uticajem brojnih faktora koji se vezuju za izbor biljke domaćina, klimatske uslove, ishranu, prisustvo drugih mikroorganizama u istom okruženju itd. Pošto je u literaturi primećen veliki broj različitih indikatora antibakterijske aktivnosti endofitnih gljiva, izvršena je njihova kritička procena korišćenjem analitičkih metoda pretrage podataka. Razmatrana je aktivnost prema nekoliko sojeva patogenih bakterija koje su pokazale endofitne gljive koje rastu na različitim biljkama domaćinima, listopadnom drveću i zeljastim biljkama širom sveta i u različitim klimatskim uslovima, kao i taksonomska rasprostranjenost vr...sta endofitnih gljiva. Istraživanje velike grupe podataka je vršeno pomoću analize glavnih komponenata (eng. Principal component analysis) sa ciljem pronalaženja obrazaca u podacima koji bi ukazali na manji broj pravih kandidata za dalji razvoj lekova. Osvetljen je antimikrobni karakter Phomopsis vrsta, a takođe su procenjeni i budući pravci u njegovoj terapijskoj primeni.
Ključne reči:
Endophytic fungi / Antibiotic drug discovery / Bacterial resistance / Principal component analysis / Bakterijska rezistencija / endofitne gljive / analiza glavnih komponenata / razvoj novih antibiotskih lekovaIzvor:
Arhiv za farmaciju, 2020, 70, 3, 142-156Izdavač:
- Pharmaceutical Association of Serbia
Finansiranje / projekti:
- Ministarstvo nauke, tehnološkog razvoja i inovacija Republike Srbije, institucionalno finansiranje - 200161 (Univerzitet u Beogradu, Farmaceutski fakultet) (RS-MESTD-inst-2020-200161)
Institucija/grupa
PharmacyTY - JOUR AU - Otašević, Biljana AU - Krmar, Jovana AU - Đajić, Nevena AU - Ignjatović, Janko AU - Protić, Ana PY - 2020 UR - https://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/3662 AB - Drug resistance, especially bacterial antibiotic resistance, is recognized as a global phenomenon. Potential of endophytic fungi as producers of secondary metabolites with wide spectra of different bioactivities in the field of drug discovery has recently been introduced. The production of these compounds is under the great impact of the variety of factors related to the choice of plant host, climate conditions, nutrition, presence of other microorganisms in the same surrounding, etc. Due to a large number of different indices of endophytic fungi antibacterial activity, critical evaluation with the assistance of data mining analytical methods was performed. The activity towards several pathogen bacteria of endophytes species growing on different plant hosts, deciduous trees as well as herbaceous plants spread worldwide in different climatic zones together with the taxonomy of endophytes was taken into consideration. The principal component analysis was used to explore formed big data set and through finding patterns in data, to point out to a limited number of proper candidates for future pharmaceutical research. The antimicrobial character of Phomopsis species was highlighted and future perspectives in their therapeutic use were projected. AB - Rezistencija na lekove, posebno rezistencija bakterija na delovanje antibiotika, smatra se globalnim problemom. Na polju razvoja novih lekova nedavno su se pojavile endofitne gljive zahvaljujući sposobnosti da proizvedu sekundarne metabolite sa širokim spektrom različitih bioloških aktivnosti. Biosinteza ovih jedinjenja je pod velikim uticajem brojnih faktora koji se vezuju za izbor biljke domaćina, klimatske uslove, ishranu, prisustvo drugih mikroorganizama u istom okruženju itd. Pošto je u literaturi primećen veliki broj različitih indikatora antibakterijske aktivnosti endofitnih gljiva, izvršena je njihova kritička procena korišćenjem analitičkih metoda pretrage podataka. Razmatrana je aktivnost prema nekoliko sojeva patogenih bakterija koje su pokazale endofitne gljive koje rastu na različitim biljkama domaćinima, listopadnom drveću i zeljastim biljkama širom sveta i u različitim klimatskim uslovima, kao i taksonomska rasprostranjenost vrsta endofitnih gljiva. Istraživanje velike grupe podataka je vršeno pomoću analize glavnih komponenata (eng. Principal component analysis) sa ciljem pronalaženja obrazaca u podacima koji bi ukazali na manji broj pravih kandidata za dalji razvoj lekova. Osvetljen je antimikrobni karakter Phomopsis vrsta, a takođe su procenjeni i budući pravci u njegovoj terapijskoj primeni. PB - Pharmaceutical Association of Serbia T2 - Arhiv za farmaciju T1 - Chemometric window to antimicrobial activity of biomolecules isolated from endophytic fungi T1 - Hemometrijski prozor ka antibakterijskoj aktivnosti biomolekula izolovanih iz endofitnih gljiva VL - 70 IS - 3 SP - 142 EP - 156 DO - 10.5937/arhfarm2003142O ER -
@article{ author = "Otašević, Biljana and Krmar, Jovana and Đajić, Nevena and Ignjatović, Janko and Protić, Ana", year = "2020", abstract = "Drug resistance, especially bacterial antibiotic resistance, is recognized as a global phenomenon. Potential of endophytic fungi as producers of secondary metabolites with wide spectra of different bioactivities in the field of drug discovery has recently been introduced. The production of these compounds is under the great impact of the variety of factors related to the choice of plant host, climate conditions, nutrition, presence of other microorganisms in the same surrounding, etc. Due to a large number of different indices of endophytic fungi antibacterial activity, critical evaluation with the assistance of data mining analytical methods was performed. The activity towards several pathogen bacteria of endophytes species growing on different plant hosts, deciduous trees as well as herbaceous plants spread worldwide in different climatic zones together with the taxonomy of endophytes was taken into consideration. The principal component analysis was used to explore formed big data set and through finding patterns in data, to point out to a limited number of proper candidates for future pharmaceutical research. The antimicrobial character of Phomopsis species was highlighted and future perspectives in their therapeutic use were projected., Rezistencija na lekove, posebno rezistencija bakterija na delovanje antibiotika, smatra se globalnim problemom. Na polju razvoja novih lekova nedavno su se pojavile endofitne gljive zahvaljujući sposobnosti da proizvedu sekundarne metabolite sa širokim spektrom različitih bioloških aktivnosti. Biosinteza ovih jedinjenja je pod velikim uticajem brojnih faktora koji se vezuju za izbor biljke domaćina, klimatske uslove, ishranu, prisustvo drugih mikroorganizama u istom okruženju itd. Pošto je u literaturi primećen veliki broj različitih indikatora antibakterijske aktivnosti endofitnih gljiva, izvršena je njihova kritička procena korišćenjem analitičkih metoda pretrage podataka. Razmatrana je aktivnost prema nekoliko sojeva patogenih bakterija koje su pokazale endofitne gljive koje rastu na različitim biljkama domaćinima, listopadnom drveću i zeljastim biljkama širom sveta i u različitim klimatskim uslovima, kao i taksonomska rasprostranjenost vrsta endofitnih gljiva. Istraživanje velike grupe podataka je vršeno pomoću analize glavnih komponenata (eng. Principal component analysis) sa ciljem pronalaženja obrazaca u podacima koji bi ukazali na manji broj pravih kandidata za dalji razvoj lekova. Osvetljen je antimikrobni karakter Phomopsis vrsta, a takođe su procenjeni i budući pravci u njegovoj terapijskoj primeni.", publisher = "Pharmaceutical Association of Serbia", journal = "Arhiv za farmaciju", title = "Chemometric window to antimicrobial activity of biomolecules isolated from endophytic fungi, Hemometrijski prozor ka antibakterijskoj aktivnosti biomolekula izolovanih iz endofitnih gljiva", volume = "70", number = "3", pages = "142-156", doi = "10.5937/arhfarm2003142O" }
Otašević, B., Krmar, J., Đajić, N., Ignjatović, J.,& Protić, A.. (2020). Chemometric window to antimicrobial activity of biomolecules isolated from endophytic fungi. in Arhiv za farmaciju Pharmaceutical Association of Serbia., 70(3), 142-156. https://doi.org/10.5937/arhfarm2003142O
Otašević B, Krmar J, Đajić N, Ignjatović J, Protić A. Chemometric window to antimicrobial activity of biomolecules isolated from endophytic fungi. in Arhiv za farmaciju. 2020;70(3):142-156. doi:10.5937/arhfarm2003142O .
Otašević, Biljana, Krmar, Jovana, Đajić, Nevena, Ignjatović, Janko, Protić, Ana, "Chemometric window to antimicrobial activity of biomolecules isolated from endophytic fungi" in Arhiv za farmaciju, 70, no. 3 (2020):142-156, https://doi.org/10.5937/arhfarm2003142O . .