FarFaR - Pharmacy Repository
University of Belgrade, Faculty of Pharmacy
    • English
    • Српски
    • Српски (Serbia)
  • English 
    • English
    • Serbian (Cyrillic)
    • Serbian (Latin)
  • Login
View Item 
  •   FarFaR
  • Pharmacy
  • Radovi istraživača / Researchers’ publications
  • View Item
  •   FarFaR
  • Pharmacy
  • Radovi istraživača / Researchers’ publications
  • View Item
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase

3D-QSAR студија аналога аденозин 5'-фосфосулфата (APS) као лиганда за APS редуктазу

Thumbnail
2021
3D-QSAR_study_of_pub_2021.pdf (2.590Mb)
Authors
Erić, Slavica
Cvijetić, Ilija
Zloh, Mire
Article (Published version)
Metadata
Show full item record
Abstract
Metabolism of sulfur (sulfur assimilation pathway, SAP) is one of the key pathways for the pathogenesis and survival of persistant bacteria, such as Mycobacterium tuberculosis (Mtb), in the latent period. Adenosine 5'-phosphosulfate reductase (APSR) is an important enzyme involved in the SAP, absent from the human body, so it might represent a valid target for development of new antituberculosis drugs. This work aimed to develop 3D-QSAR model based on the crystal structure of APSR from Pseudomonas aeruginosa, which shows high degree of homology with APSR from Mtb, in complex with its substrate, adenosine 5'-phosphosulfate (APS). 3D-QSAR model was built from a set of 16 nucleotide analogues of APS using alignment-independent descriptors derived from molecular interaction fields (MIF). The model improves the understanding of the key characteristics of molecules necessary for the interaction with target, and enables the rational design of novel small molecule inhibitors of Mtb APSR.
Метаболизам сумпора (пут асимилације сумпора, SAP) један је од кључних путева за патогенезу и преживљавање Mycobacterium tuberculosis (Mtb) у латентном периоду. Аденозин 5'-фосфосфат редуктаза (APSR) је значајан ензим који је укључен у SAP, не налази се у људском организму и може бити валиднo циљно место за развој нових анти- туберкулотика. Циљ овог рада је развој 3D-QSAR модела који се заснива на кристалној структури APSR из Pseudomonas aeruginosa, који има висок степен хомологије са APSR из Mtb, у комплексу са супстратом, аденозин 5'-фосфoсулфатом (APS). 3D-QSAR модел је постављен коришћењем сета 16 нуклеотидних аналога APS применом дескриптора неза- висних од полазних тачака, изведених из поља молекуларних интеракција (MIF). Модел служи за боље разумевање кључних карактеристика молекула неопходних за интерак- цију са циљним местом, у сврху рационалног дизајнирања малих молекула, инхибитора APSR из Mtb.
Keywords:
Interactions / Mif / Pentacle / Pls / Sulfur assimilation pathway
Source:
Journal of the Serbian Chemical Society, 2021, 86, 6, 561-570
Publisher:
  • Belgrade: Serbian Chemical Society
Funding / projects:
  • Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200161 (University of Belgrade, Faculty of Pharmacy) (RS-200161)
  • Ministry of Education, Science and Technological Development, Republic of Serbia, Grant no. 200168 (University of Belgrade, Faculty of Chemistry) (RS-200168)

DOI: 10.2298/JSC201128015E

ISSN: 0352-5139

WoS: 000669486500003

Scopus: 2-s2.0-85110951672
[ Google Scholar ]
URI
https://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/3929
Collections
  • Radovi istraživača / Researchers’ publications
Institution/Community
Pharmacy
TY  - JOUR
AU  - Erić, Slavica
AU  - Cvijetić, Ilija
AU  - Zloh, Mire
PY  - 2021
UR  - https://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/3929
AB  - Metabolism of sulfur (sulfur assimilation pathway, SAP) is one of the key pathways for the pathogenesis and survival of persistant bacteria, such as Mycobacterium tuberculosis (Mtb), in the latent period. Adenosine 5'-phosphosulfate reductase (APSR) is an important enzyme involved in the SAP, absent from the human body, so it might represent a valid target for development of new antituberculosis drugs. This work aimed to develop 3D-QSAR model based on the crystal structure of APSR from Pseudomonas aeruginosa, which shows high degree of homology with APSR from Mtb, in complex with its substrate, adenosine 5'-phosphosulfate (APS). 3D-QSAR model was built from a set of 16 nucleotide analogues of APS using alignment-independent descriptors derived from molecular interaction fields (MIF). The model improves the understanding of the key characteristics of molecules necessary for the interaction with target, and enables the rational design of novel small molecule inhibitors of Mtb APSR.
AB  - Метаболизам  сумпора (пут асимилације  сумпора, SAP) један је од кључних путева  за  патогенезу  и  преживљавање  Mycobacterium  tuberculosis  (Mtb)  у  латентном  периоду.  Аденозин  5'-фосфосфат  редуктаза  (APSR)  је  значајан  ензим  који  је  укључен  у  SAP,  не  налази се у људском организму и може бити валиднo циљно место за развој нових анти- туберкулотика.  Циљ  овог  рада  је  развој  3D-QSAR  модела  који  се  заснива  на  кристалној  структури APSR из Pseudomonas aeruginosa, који има висок степен хомологије са APSR из  Mtb, у комплексу са супстратом, аденозин 5'-фосфoсулфатом (APS). 3D-QSAR модел је  постављен коришћењем сета 16 нуклеотидних аналога APS применом дескриптора неза- висних од полазних тачака, изведених из поља молекуларних интеракција (MIF). Модел  служи  за  боље  разумевање  кључних  карактеристика  молекула  неопходних  за  интерак- цију са циљним местом, у сврху рационалног дизајнирања малих молекула, инхибитора  APSR из Mtb.
PB  - Belgrade: Serbian Chemical Society
T2  - Journal of the Serbian Chemical Society
T1  - 3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase
T1  - 3D-QSAR студија аналога аденозин 5'-фосфосулфата (APS) као лиганда за APS редуктазу
VL  - 86
IS  - 6
SP  - 561
EP  - 570
DO  - 10.2298/JSC201128015E
ER  - 
@article{
author = "Erić, Slavica and Cvijetić, Ilija and Zloh, Mire",
year = "2021",
abstract = "Metabolism of sulfur (sulfur assimilation pathway, SAP) is one of the key pathways for the pathogenesis and survival of persistant bacteria, such as Mycobacterium tuberculosis (Mtb), in the latent period. Adenosine 5'-phosphosulfate reductase (APSR) is an important enzyme involved in the SAP, absent from the human body, so it might represent a valid target for development of new antituberculosis drugs. This work aimed to develop 3D-QSAR model based on the crystal structure of APSR from Pseudomonas aeruginosa, which shows high degree of homology with APSR from Mtb, in complex with its substrate, adenosine 5'-phosphosulfate (APS). 3D-QSAR model was built from a set of 16 nucleotide analogues of APS using alignment-independent descriptors derived from molecular interaction fields (MIF). The model improves the understanding of the key characteristics of molecules necessary for the interaction with target, and enables the rational design of novel small molecule inhibitors of Mtb APSR., Метаболизам  сумпора (пут асимилације  сумпора, SAP) један је од кључних путева  за  патогенезу  и  преживљавање  Mycobacterium  tuberculosis  (Mtb)  у  латентном  периоду.  Аденозин  5'-фосфосфат  редуктаза  (APSR)  је  значајан  ензим  који  је  укључен  у  SAP,  не  налази се у људском организму и може бити валиднo циљно место за развој нових анти- туберкулотика.  Циљ  овог  рада  је  развој  3D-QSAR  модела  који  се  заснива  на  кристалној  структури APSR из Pseudomonas aeruginosa, који има висок степен хомологије са APSR из  Mtb, у комплексу са супстратом, аденозин 5'-фосфoсулфатом (APS). 3D-QSAR модел је  постављен коришћењем сета 16 нуклеотидних аналога APS применом дескриптора неза- висних од полазних тачака, изведених из поља молекуларних интеракција (MIF). Модел  служи  за  боље  разумевање  кључних  карактеристика  молекула  неопходних  за  интерак- цију са циљним местом, у сврху рационалног дизајнирања малих молекула, инхибитора  APSR из Mtb.",
publisher = "Belgrade: Serbian Chemical Society",
journal = "Journal of the Serbian Chemical Society",
title = "3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase, 3D-QSAR студија аналога аденозин 5'-фосфосулфата (APS) као лиганда за APS редуктазу",
volume = "86",
number = "6",
pages = "561-570",
doi = "10.2298/JSC201128015E"
}
Erić, S., Cvijetić, I.,& Zloh, M.. (2021). 3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase. in Journal of the Serbian Chemical Society
Belgrade: Serbian Chemical Society., 86(6), 561-570.
https://doi.org/10.2298/JSC201128015E
Erić S, Cvijetić I, Zloh M. 3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase. in Journal of the Serbian Chemical Society. 2021;86(6):561-570.
doi:10.2298/JSC201128015E .
Erić, Slavica, Cvijetić, Ilija, Zloh, Mire, "3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase" in Journal of the Serbian Chemical Society, 86, no. 6 (2021):561-570,
https://doi.org/10.2298/JSC201128015E . .

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
About FarFaR - Pharmacy Repository | Send Feedback

OpenAIRERCUB
 

 

All of DSpaceCommunitiesAuthorsTitlesSubjectsThis institutionAuthorsTitlesSubjects

Statistics

View Usage Statistics

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
About FarFaR - Pharmacy Repository | Send Feedback

OpenAIRERCUB