Show simple item record

3D-QSAR студија аналога аденозин 5'-фосфосулфата (APS) као лиганда за APS редуктазу

dc.creatorErić, Slavica
dc.creatorCvijetić, Ilija
dc.creatorZloh, Mire
dc.date.accessioned2021-08-04T10:53:18Z
dc.date.available2021-08-04T10:53:18Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.issn0352-5139
dc.identifier.urihttps://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/3929
dc.description.abstractMetabolism of sulfur (sulfur assimilation pathway, SAP) is one of the key pathways for the pathogenesis and survival of persistant bacteria, such as Mycobacterium tuberculosis (Mtb), in the latent period. Adenosine 5'-phosphosulfate reductase (APSR) is an important enzyme involved in the SAP, absent from the human body, so it might represent a valid target for development of new antituberculosis drugs. This work aimed to develop 3D-QSAR model based on the crystal structure of APSR from Pseudomonas aeruginosa, which shows high degree of homology with APSR from Mtb, in complex with its substrate, adenosine 5'-phosphosulfate (APS). 3D-QSAR model was built from a set of 16 nucleotide analogues of APS using alignment-independent descriptors derived from molecular interaction fields (MIF). The model improves the understanding of the key characteristics of molecules necessary for the interaction with target, and enables the rational design of novel small molecule inhibitors of Mtb APSR.
dc.description.abstractМетаболизам сумпора (пут асимилације сумпора, SAP) један је од кључних путева за патогенезу и преживљавање Mycobacterium tuberculosis (Mtb) у латентном периоду. Аденозин 5'-фосфосфат редуктаза (APSR) је значајан ензим који је укључен у SAP, не налази се у људском организму и може бити валиднo циљно место за развој нових анти- туберкулотика. Циљ овог рада је развој 3D-QSAR модела који се заснива на кристалној структури APSR из Pseudomonas aeruginosa, који има висок степен хомологије са APSR из Mtb, у комплексу са супстратом, аденозин 5'-фосфoсулфатом (APS). 3D-QSAR модел је постављен коришћењем сета 16 нуклеотидних аналога APS применом дескриптора неза- висних од полазних тачака, изведених из поља молекуларних интеракција (MIF). Модел служи за боље разумевање кључних карактеристика молекула неопходних за интерак- цију са циљним местом, у сврху рационалног дизајнирања малих молекула, инхибитора APSR из Mtb.
dc.publisherBelgrade: Serbian Chemical Society
dc.relationinfo:eu-repo/grantAgreement/MESTD/inst-2020/200161/RS//
dc.relationinfo:eu-repo/grantAgreement/MESTD/inst-2020/200168/RS//
dc.rightsopenAccess
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.sourceJournal of the Serbian Chemical Society
dc.subjectInteractions
dc.subjectMif
dc.subjectPentacle
dc.subjectPls
dc.subjectSulfur assimilation pathway
dc.title3D-QSAR study of adenosine 5'-phosphosulfate (APS) analouges as ligands for APS reductase
dc.title3D-QSAR студија аналога аденозин 5'-фосфосулфата (APS) као лиганда за APS редуктазу
dc.typearticle
dc.rights.licenseBY-NC-ND
dcterms.abstractЗлох, Мире; Цвијетић, Илија; Ерић, Славица; 3D-QSAR studija analoga adenozin 5'-fosfosulfata (APS) kao liganda za APS reduktazu;
dc.citation.volume86
dc.citation.issue6
dc.citation.spage561
dc.citation.epage570
dc.identifier.wos000669486500003
dc.identifier.doi10.2298/JSC201128015E
dc.identifier.scopus2-s2.0-85110951672
dc.identifier.fulltexthttps://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/bitstream/id/9065/3D-QSAR_study_of_pub_2021.pdf
dc.type.versionpublishedVersion


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record