Синтеза, електрохемијско испитивање интеракција са ДНК и in vitro антитуморска активност аминокиселинских деривата акридина
Synthesis, electrochemical study of interaction with DNA and in vitro evaluation of anticancer activity of new acridinyl amino acid derivatives
Аутори
Rupar, JelenaОстала ауторства
Čudina, OliveraAleksić, Mara
Brborić, Jasmina
Dobričić, Vladimir
Janošević-Ležaić, Aleksandra
Grahovac, Jelena
Докторска теза (Објављена верзија)
Метаподаци
Приказ свих података о документуАпстракт
У овој дисертацији су описани процеси синтезе, пречишћавања и физичко-хемијске карактеризације аминокиселинских деривата акридина: (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-фенилпропаноата (1), (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1H-имидазол-4-ил)пропаноата (2), (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1-метил-1H-индол-3-ил)пропаноата (3), (S)-2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1-метил-1H-индол-3-ил)пропанске киселине (4), метил-8-(акридин-9-ил-амино)октаноата (5), етил 4-(акридин-9-ил-амино)бутаноата (6), пропил 4-(акридин-9-ил-амино)бутаноата (7), етил 3-(акридин-9-ил-амино)пропаноата (8), пропил 3-(акридин-9-ил-амино)пропаноата (9), етил 6-(акридин-9-ил-амино)хексаноата (10) и пропил 6-(акридин-9-ил-амино)хексаноата (11).Испитивање антитуморске активности обухватило је испитивање цитотоксичности, клоногени есеј, испитивање утицаја синтетисаних једињења на ћелијски циклус и анализу ћелијске смрти. МТТ тестом утврђено је да једињења 6, 7, 8 и 9 имају IC50 < 20 μМ. Ова једињења могу инхибирати хуману ДНК т...опоизомеразу IIα.Испитано је електрохемијско понашање 9-хлороакридина и једињења 6, 7, 8 и 9 применом цикличне, диференцијално пулсне и волтаметрије правоугаоних таласа, на електроди од стакластог угљеника. 9-хлороакридин подлеже иреверзибилним, рН зависним и дифузионо-контролисаним процесима оксидације и редукције. Електрохемијски ДНК биосензор коришћен је са циљем испитивања интеракције 9-хлороакридина и једињења 6, 7, 8 и 9 са ДНК, применом волтаметрије правоугаоних таласа на електроди од стакластог угљеника.9-хлороакридин и једињења 6, 7, 8 и 9 интеркалирају између база ДНК. Јачина интеракције није била иста за сва једињења, а примећен је и утицај концентрације испитиваног једињења на вредност константе везивања. Интеркалација је потврђена применом молекулског docking-а.
This dissertation describes synthesis, purification and physicochemical characterization of amino acid derivatives of acridine: (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-phenylpropanoate (1), (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-(1H-imidazol-4-yl)propanoate (2), (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoate (3), (S)-2-(acridin-9-ylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoic acid (4), methyl 8-(acridin-9-ylamino)octanoate (5), ethyl 4-(acridin-9-ylamino)butanoate (6), propyl 4-(acridin-9-ylamino)butanoate (7), ethyl 3-(acridin-9-ylamino)propanoate (8), propyl 3-(acridin-9-ylamino)propanoate (9), ethyl 6-(acridin-9-ylamino)hexanoate (10) and propyl 6-(acridin-9-ylamino)hexanoate (11).In vitro anticancer activity tests included citotoxity, long-term survival assay, cell cycle analysis and cell death analysis. Compounds 6, 7, 8 and 9 were found to have IC50 < 20 μМ by MTT test. The inhibitory activity on human DNA topoisomerase IIα was confirmed.The electrochemical redox beha...vior of 9-chloroacridine and compounds 6, 7, 8 and 9, was investigated using cyclic, differential pulse and square wave voltammetry, on a glassy carbon electrode. The results indicated that 9-chloroacridine undergoes irreversible, pH dependent and diffusion-controlled redox processes.An electrochemical DNA biosensor was used to investigate the interaction of 9-chloroacridine and compounds 6 ,7, 8 and 9 with DNA using square wave voltammetry on a glassy carbon electrode.9-chloroacridine and compounds 6, 7, 8 and 9 intercalate between DNA bases, whereby the strength of the interaction was not the same for all compounds, and the influence of the concentration of the tested compounds on the value of the binding constant was also observed. The intercalation was confirmed by molecular docking.
Кључне речи:
аминокиселински деривати акридина / синтеза / антитуморска активност / инхибиција ДНК топоизомеразе IIα / волтаметрија / електрохемијски ДНК биосензор / amino acid derivatives of acridine / synthesis / anticancer activity / DNA topoisomerase IIα inhibition / voltammetry / electrochemical DNA biosensorИзвор:
Универзитет у Београду, 2023Издавач:
- Универзитет у Београду, Фармацеутски факултет
URI
https://eteze.bg.ac.rs/application/showtheses?thesesId=9631https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:33735/bdef:Content/download
https://plus.cobiss.net/cobiss/sr/sr/bib/138432265
https://nardus.mpn.gov.rs/handle/123456789/22491
https://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/5666
Колекције
Институција/група
PharmacyTY - THES AU - Rupar, Jelena PY - 2023 UR - https://eteze.bg.ac.rs/application/showtheses?thesesId=9631 UR - https://fedorabg.bg.ac.rs/fedora/get/o:33735/bdef:Content/download UR - https://plus.cobiss.net/cobiss/sr/sr/bib/138432265 UR - https://nardus.mpn.gov.rs/handle/123456789/22491 UR - https://farfar.pharmacy.bg.ac.rs/handle/123456789/5666 AB - У овој дисертацији су описани процеси синтезе, пречишћавања и физичко-хемијске карактеризације аминокиселинских деривата акридина: (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-фенилпропаноата (1), (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1H-имидазол-4-ил)пропаноата (2), (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1-метил-1H-индол-3-ил)пропаноата (3), (S)-2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1-метил-1H-индол-3-ил)пропанске киселине (4), метил-8-(акридин-9-ил-амино)октаноата (5), етил 4-(акридин-9-ил-амино)бутаноата (6), пропил 4-(акридин-9-ил-амино)бутаноата (7), етил 3-(акридин-9-ил-амино)пропаноата (8), пропил 3-(акридин-9-ил-амино)пропаноата (9), етил 6-(акридин-9-ил-амино)хексаноата (10) и пропил 6-(акридин-9-ил-амино)хексаноата (11).Испитивање антитуморске активности обухватило је испитивање цитотоксичности, клоногени есеј, испитивање утицаја синтетисаних једињења на ћелијски циклус и анализу ћелијске смрти. МТТ тестом утврђено је да једињења 6, 7, 8 и 9 имају IC50 < 20 μМ. Ова једињења могу инхибирати хуману ДНК топоизомеразу IIα.Испитано је електрохемијско понашање 9-хлороакридина и једињења 6, 7, 8 и 9 применом цикличне, диференцијално пулсне и волтаметрије правоугаоних таласа, на електроди од стакластог угљеника. 9-хлороакридин подлеже иреверзибилним, рН зависним и дифузионо-контролисаним процесима оксидације и редукције. Електрохемијски ДНК биосензор коришћен је са циљем испитивања интеракције 9-хлороакридина и једињења 6, 7, 8 и 9 са ДНК, применом волтаметрије правоугаоних таласа на електроди од стакластог угљеника.9-хлороакридин и једињења 6, 7, 8 и 9 интеркалирају између база ДНК. Јачина интеракције није била иста за сва једињења, а примећен је и утицај концентрације испитиваног једињења на вредност константе везивања. Интеркалација је потврђена применом молекулског docking-а. AB - This dissertation describes synthesis, purification and physicochemical characterization of amino acid derivatives of acridine: (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-phenylpropanoate (1), (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-(1H-imidazol-4-yl)propanoate (2), (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoate (3), (S)-2-(acridin-9-ylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoic acid (4), methyl 8-(acridin-9-ylamino)octanoate (5), ethyl 4-(acridin-9-ylamino)butanoate (6), propyl 4-(acridin-9-ylamino)butanoate (7), ethyl 3-(acridin-9-ylamino)propanoate (8), propyl 3-(acridin-9-ylamino)propanoate (9), ethyl 6-(acridin-9-ylamino)hexanoate (10) and propyl 6-(acridin-9-ylamino)hexanoate (11).In vitro anticancer activity tests included citotoxity, long-term survival assay, cell cycle analysis and cell death analysis. Compounds 6, 7, 8 and 9 were found to have IC50 < 20 μМ by MTT test. The inhibitory activity on human DNA topoisomerase IIα was confirmed.The electrochemical redox behavior of 9-chloroacridine and compounds 6, 7, 8 and 9, was investigated using cyclic, differential pulse and square wave voltammetry, on a glassy carbon electrode. The results indicated that 9-chloroacridine undergoes irreversible, pH dependent and diffusion-controlled redox processes.An electrochemical DNA biosensor was used to investigate the interaction of 9-chloroacridine and compounds 6 ,7, 8 and 9 with DNA using square wave voltammetry on a glassy carbon electrode.9-chloroacridine and compounds 6, 7, 8 and 9 intercalate between DNA bases, whereby the strength of the interaction was not the same for all compounds, and the influence of the concentration of the tested compounds on the value of the binding constant was also observed. The intercalation was confirmed by molecular docking. PB - Универзитет у Београду, Фармацеутски факултет T2 - Универзитет у Београду T1 - Синтеза, електрохемијско испитивање интеракција са ДНК и in vitro антитуморска активност аминокиселинских деривата акридина UR - https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_22491 ER -
@phdthesis{ author = "Rupar, Jelena", year = "2023", abstract = "У овој дисертацији су описани процеси синтезе, пречишћавања и физичко-хемијске карактеризације аминокиселинских деривата акридина: (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-фенилпропаноата (1), (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1H-имидазол-4-ил)пропаноата (2), (S)-метил 2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1-метил-1H-индол-3-ил)пропаноата (3), (S)-2-(акридин-9-ил-амино)-3-(1-метил-1H-индол-3-ил)пропанске киселине (4), метил-8-(акридин-9-ил-амино)октаноата (5), етил 4-(акридин-9-ил-амино)бутаноата (6), пропил 4-(акридин-9-ил-амино)бутаноата (7), етил 3-(акридин-9-ил-амино)пропаноата (8), пропил 3-(акридин-9-ил-амино)пропаноата (9), етил 6-(акридин-9-ил-амино)хексаноата (10) и пропил 6-(акридин-9-ил-амино)хексаноата (11).Испитивање антитуморске активности обухватило је испитивање цитотоксичности, клоногени есеј, испитивање утицаја синтетисаних једињења на ћелијски циклус и анализу ћелијске смрти. МТТ тестом утврђено је да једињења 6, 7, 8 и 9 имају IC50 < 20 μМ. Ова једињења могу инхибирати хуману ДНК топоизомеразу IIα.Испитано је електрохемијско понашање 9-хлороакридина и једињења 6, 7, 8 и 9 применом цикличне, диференцијално пулсне и волтаметрије правоугаоних таласа, на електроди од стакластог угљеника. 9-хлороакридин подлеже иреверзибилним, рН зависним и дифузионо-контролисаним процесима оксидације и редукције. Електрохемијски ДНК биосензор коришћен је са циљем испитивања интеракције 9-хлороакридина и једињења 6, 7, 8 и 9 са ДНК, применом волтаметрије правоугаоних таласа на електроди од стакластог угљеника.9-хлороакридин и једињења 6, 7, 8 и 9 интеркалирају између база ДНК. Јачина интеракције није била иста за сва једињења, а примећен је и утицај концентрације испитиваног једињења на вредност константе везивања. Интеркалација је потврђена применом молекулског docking-а., This dissertation describes synthesis, purification and physicochemical characterization of amino acid derivatives of acridine: (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-phenylpropanoate (1), (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-(1H-imidazol-4-yl)propanoate (2), (S)-methyl 2-(acridin-9-ylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoate (3), (S)-2-(acridin-9-ylamino)-3-(1-methyl-1H-indol-3-yl)propanoic acid (4), methyl 8-(acridin-9-ylamino)octanoate (5), ethyl 4-(acridin-9-ylamino)butanoate (6), propyl 4-(acridin-9-ylamino)butanoate (7), ethyl 3-(acridin-9-ylamino)propanoate (8), propyl 3-(acridin-9-ylamino)propanoate (9), ethyl 6-(acridin-9-ylamino)hexanoate (10) and propyl 6-(acridin-9-ylamino)hexanoate (11).In vitro anticancer activity tests included citotoxity, long-term survival assay, cell cycle analysis and cell death analysis. Compounds 6, 7, 8 and 9 were found to have IC50 < 20 μМ by MTT test. The inhibitory activity on human DNA topoisomerase IIα was confirmed.The electrochemical redox behavior of 9-chloroacridine and compounds 6, 7, 8 and 9, was investigated using cyclic, differential pulse and square wave voltammetry, on a glassy carbon electrode. The results indicated that 9-chloroacridine undergoes irreversible, pH dependent and diffusion-controlled redox processes.An electrochemical DNA biosensor was used to investigate the interaction of 9-chloroacridine and compounds 6 ,7, 8 and 9 with DNA using square wave voltammetry on a glassy carbon electrode.9-chloroacridine and compounds 6, 7, 8 and 9 intercalate between DNA bases, whereby the strength of the interaction was not the same for all compounds, and the influence of the concentration of the tested compounds on the value of the binding constant was also observed. The intercalation was confirmed by molecular docking.", publisher = "Универзитет у Београду, Фармацеутски факултет", journal = "Универзитет у Београду", title = "Синтеза, електрохемијско испитивање интеракција са ДНК и in vitro антитуморска активност аминокиселинских деривата акридина", url = "https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_22491" }
Rupar, J.. (2023). Синтеза, електрохемијско испитивање интеракција са ДНК и in vitro антитуморска активност аминокиселинских деривата акридина. in Универзитет у Београду Универзитет у Београду, Фармацеутски факултет.. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_22491
Rupar J. Синтеза, електрохемијско испитивање интеракција са ДНК и in vitro антитуморска активност аминокиселинских деривата акридина. in Универзитет у Београду. 2023;. https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_22491 .
Rupar, Jelena, "Синтеза, електрохемијско испитивање интеракција са ДНК и in vitro антитуморска активност аминокиселинских деривата акридина" in Универзитет у Београду (2023), https://hdl.handle.net/21.15107/rcub_nardus_22491 .